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机构名称：
¥ 1.0
无论是单链的RNA还是合成聚合物，多支着聚会的封装都是由病毒外套蛋白的正带，结构无序的RNA结合结构域之间的有吸引力的静电相互作用驱动的。从理论上讲，这种相互作用通常是通过将结合结构域的电荷分布进行的，要么是通过将电荷投射到蛋白质壳的内表面，要么通过将它们传播到代表结合结构域所在的衣壳中的区域。在实践中，正电荷并不均匀地分布在结合域中，它们本身位于壳表面上的离散的特定位置。在这里，我们使用分子动力学模拟来研究局部相互作用对封装聚合物最可能或最佳长度的影响，这表明沿结合域的电荷的特定位置与实验观察结果一致。将模拟与从文献中获得的简单均值理论的预测进行比较，我们发现，尽管一般趋势被合理地捕获，但两种方法之间会产生定量差异。
arxiv：2501.13891v1 [physics.bio-ph] 2025年1月23日
主要关键词
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